MSYS est une collection d'utilitaires GNU tels que bash, make, gawk et grep pour permettre la construction d'applications et de programmes qui dépendent des outils UNIX traditionnels.Il est destiné à compléter MinGW et les carences de la coque cmd.Un exemple serait la construction d'une bibliothèque qui utilise le système de construction autotools.Les utilisateurs exécuteront généralement "./configure" puis "make" pour le créer.Le script shell de configuration nécessite un interpréteur de script shell qui n'est pas présent sur les systèmes Windows, mais fourni par MSYS ....