Cytoscape est une plate-forme logicielle open source pour visualiser des réseaux complexes et les intégrer à tout type de données d'attributs.De nombreux plugins sont disponibles pour différents types de domaines problématiques, y compris la bioinformatique, l'analyse des réseaux sociaux et le Web sémantique.Cytoscape prend en charge de nombreux cas d'utilisation en biologie moléculaire et des systèmes, en génomique et en protéomique: chargez des ensembles de données d'interaction moléculaire et génétique dans de nombreux formats Projetez et intégrez des ensembles de données mondiaux et des annotations fonctionnelles Établissez des cartographies visuelles puissantes sur ces données Effectuez une analyse et une modélisation avancées à l'aide des plugins Cytoscape Visualisezet analyser des ensembles de données de voies organisées par l'homme tels que Reactome ou KEGG.