BioBlender est un progiciel construit sur le logiciel de modélisation 3D open source.La biologie fonctionne à l'échelle nanométrique, avec des objets invisibles à l'œil humain.Avec BioBlender, il est possible de montrer certains des personnages qui peuplent nos cellules, sur la base de données scientifiques et du plus haut standard de manipulation 3D.Des scientifiques du monde entier étudient les protéines au niveau atomique et déposent des informations dans le référentiel public Protein Data Bank, où chaque molécule est décrite comme la liste de ses atomes et leurs coordonnées 3D .... Avec BioBlender, les utilisateurs peuvent manipuler des protéines dans l'espace 3D, affichant leur surface de manière photoréaliste, et élaborant des mouvements de protéines sur la base de conformations connues.Les fichiers PDB peuvent être chargés à partir d'un répertoire défini par l'utilisateur ou téléchargés directement à partir du site PDB (en insérant le code PDB).La protéine est affichée en 3D (sous forme d'atomes ou de surface moléculaire) et l'utilisateur peut calculer et visualiser ses propriétés de surface, le potentiel lipophile moléculaire et le potentiel électrostatique.Pour le mouvement des protéines, BioBlender calcule les intermédiaires entre deux conformations à l'aide de Blender Game Engine.Le programme donne en sortie à la fois les fichiers PDB intermédiaires et les images rendues sous forme de film.BioBlender est une implémentation de Blender, un programme open source, librement distribué, multiplateforme, interopérable et soutenu d'animation 3D, d'effets visuels et de jeux vidéo.La combinaison de l'infographie 3D, du moteur de jeu et des programmes scientifiques font de BioBlender un instrument complet pour élaborer le mouvement des protéines et afficher leurs caractéristiques de surface à l'aide d'un code visuel basé sur la texturation et les effets spéciaux des particules.De cette façon, il est possible de montrer les propriétés physiques et chimiques d'une molécule en mouvement.BioBlender est le résultat d'une collaboration, animée par le groupe SciVis au CNR de Pise (Italie), entre scientifiques de différentes disciplines (biologie, chimie, physique, informatique) et