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Mutagen utilise une version bidirectionnelle de l'algorithme rsync pour synchroniser en toute sécurité, de manière évolutive et efficace le contenu du système de fichiers entre des paires arbitraires d'emplacements en temps quasi réel.La prise en charge est actuellement implémentée pour les emplacements sur les systèmes de fichiers locaux, les systèmes de fichiers accessibles par SSH et les systèmes de fichiers de conteneur Docker.Le contenu du système de fichiers est surveillé pour les modifications aux deux emplacements et toutes les modifications non conflictuelles sont propagées automatiquement.